Anime ini berlatar di sebuah dunia fiksi di mana hampir seluruh bagiannya dikuasai oleh kerajaan Britannia — termasuk Jepang yang telah berganti nama menjadi Area 11.
Tokoh utamanya bernama Lelouch Lamperouge, seorang pangeran Britannia super jenius yang dibuang ke Area 11 oleh ayahnya.
Dengan berbekal kekuatan Geass yang diberi oleh seorang gadis penyihir immortal bernama C.C, Lelouch berusaha membalas dendam pada ayahnya dengan mengadakan pemberontakan.
Dalam aksinya, Lelouch menggunakan nama samaran Zero …, dengan tujuan agar tidak mempengaruhi kehidupan normalnya yang damai.